Contraint à la démission en février 2023 après le déclenchement de l'article 40 du code de procédure pénale pour « outrage sexiste » dans le cadre du rapport de l'inspection générale de l'Éducation, des Sports et de la Recherche diligenté par le ministère des Sports, Noël Le Graët a vu le Parquet de Paris classer sans suite cette plainte pour « harcèlement moral et sexuel ». Pour L'Equipe, l'ex-patron de la FFF a réglé ses comptes avec Amélie Oudéa-Castéra, l'ex-ministre des sports.
"Tout est parti du Qatar, où ça n'a pas été top avec madame la ministre, je ne sais pas si elle mérite que je l'appelle comme cela. Avec Florence Hardouin (alors directrice générale), elles se sont rencontrées, je n'ai pas toujours été très aimable avec Oudéa-Castéra, qui ne se conduisait pas comme une ministre. Je lui ai dit vertement" a-t-il déclaré. "Si tout est parti de là ? Son administration a fait une enquête à charge, avec l'audition d'une quarantaine de personnes. J'avais rencontré le patron de cette mission, M. Béthune, qui m'avait dit : "Il n'y a rien, vous pouvez partir en Martinique", où je souhaitais me rendre pour me reposer. Il me rappelle une fois là-bas et me dit : "Je dois déclencher l'article 40" (*). Après on apprend par Le Monde que la ministre a vu Florence Hardouin la veille de son audition et de la mienne. Finalement, heureusement qu'il y a eu l'article 40, car avec l'enquête administrative de la ministre, je n'aurais jamais été blanchi. Tout cela a été très douloureux."
